金湖縣人民醫院前身為寶應縣金溝區衛生所，始建于1950年10月19日，是境內建國后最早的公立衛生機構。初建時，設在金溝鎮東范姓家，有房屋8間，其中瓦房5間，草房3間。有醫生2人、護理、司藥、會計各一人，簡易病床4張。

1954年因水災遷入黎城鎮，易名為寶應縣金溝區醫院。

1958年5月5日更名為寶應縣黎城醫院，7月10日，又更名為寶應縣湖西人民醫院，監管寶應湖西衛生行政工作。

隨著金湖置縣，1960年6月，湖西人民醫院正式升格為金湖縣人民醫院，為全縣醫療技術指導中心，時有醫務人員21人，設病床30張。

1978年后，金湖縣人民醫院得到迅速發展，醫院規模逐漸擴大，醫療設備逐年更新，醫療技術水平不斷提高。

1988開始建設面積為5100平方米的6層綜合病房樓，至1990年底，人民醫院有職工253人，是建縣初的9.6倍。

1995年12月創建成為二級甲等綜合醫院，經過全院職工的努力和政府的大力支持， 2013年異地新建后醫院占地面積98.87畝，建筑面積69590平方米，醫院核定床位600張，實際開放床位700余張，職工700多名。

2015年4月獲批掛牌淮安市康復醫院。

2016年5月經過評審順利成為江蘇護理職業學院附屬醫院。

2017年10月成為南京醫科大學康達學院教學醫院。

2019年5月與東南大學附屬中大醫院集團簽約揭牌并進行深度合作。

2019年6月上海名醫專家團金湖工作站在我院簽約揭牌。

2019年8月于振坤耳鼻咽喉頭頸外科中心金湖分中心簽約揭牌。

2020年1月成為江蘇省基層特色消化科省級孵化中心培訓基地。

2020年8月加入江蘇省血液病?？坡撁死硎聠挝?。

2020年8月傳染病發熱門診樓項目開工。

2020年8月獲2019屆艾力彼醫院排行縣級醫院500強。

2020年9月實訓樓奠基開工。

2020年9月被江蘇省衛健委辦公室確認為江蘇省2020年第一批防治卒中中心。

2020年11月江蘇省婦幼保健協會發布《關于確認母嬰友好醫院的通知》（蘇婦幼協〔2020〕29號），確認為江蘇省母嬰友好醫院。

2020年11月被淮安市人力資源和社會保障局確認為淮安市工傷康復協議醫療機構。

2020年11月金湖縣人民醫院胸痛中心順利通過認證，成為國家級胸痛中心。

2020年12月南京醫科大學附屬眼科醫院“蔣沁教授工作室”簽約揭牌并合作。

2021年4月被淮安市人民政府授予淮安市五一勞動獎狀。

2021年5月南京鼓樓醫院疼痛學院金湖縣人民醫院培訓基地簽約牌。

2021年6月確認為中國幽門螺桿菌分子醫學中心診療協作中心。

2021年6月確認為江蘇省超聲介入消融診療中心成員。

2021年7月傳染病發熱門診樓正式啟用。

2021年7月榮獲全國“縣域醫療榜樣力量”系列評選“管理團隊最佳風范獎”。

2022年1月成為揚州大學醫學院教學醫院。

2022年2月與江蘇省人民醫簽約揭牌。

2022年3月，成功入選國家衛健委確定首批納入國家“千縣工程”縣醫院綜合能力提升工作的縣醫院名單。

2022年8月，南京醫科大學醫學人文研究院實踐基地正式落戶我院。

2022年8月，榮膺中國縣域衛生改善醫療服務示范獎。

2022年9月，成功入選2022年江蘇省職業教育校企合作示范組合培育項目名單。

2023年4月，2021年度全國二級公立醫院績效考核—國家監測考核成績公布，金湖縣人民醫院在全國排名第173名，在江蘇省排名第3名。

  金湖人民醫院承擔臨床醫療、醫學教育、醫學科研、預防保健等任務，是淮安市金湖縣區域醫療中心，是金湖縣醫院集團的龍頭醫院。面向未來，醫院每位職工將牢記 “誠信、仁愛、發展”院訓，踐行“服務于患者、奉獻于社會”宗旨，滿懷“關愛生命、維護健康”愿景，齊心協力將醫院建設成為蘇北地區一流的人文化、現代化、精細化的縣級綜合性醫院，并創建成為省內知名的康復醫院。